在对症下药治疗患儿结石的过程中，主要把结石分为轻证和重证。
轻证主要指b超检查发现结石，无其他伴随症状，舌淡红，苔薄腻，脉滑，指纹紫。治疗时宜利尿排石，选用的方药为三金汤加减，主要药物组成包括金钱草、海金砂、鸡内金、石苇、甘草；属肾输尿管结石的患儿，加川牛膝、王不留行；膀胱结石患儿，加竹叶、通草；肾积水患儿，加猪苓、泽泻。
重证主要指b超检查发现结石，并伴有腰腹绞痛，甚或达于外阴，小便滞涩不畅，或尿流中断，或小便混浊，或尿有砂石，或血尿。婴幼儿可表现为哭闹不安、呕吐、面色苍白、出冷汗等。舌苔腻，脉弦滑，指纹紫滞。治疗时应利尿通淋排石，选用三金汤合石苇散加减，主要药物组成包括金钱草、海金砂、鸡内金、石苇、瞿麦、扁蓄、甘草。伴腰腹疼痛的患儿，加延胡索、白芍；尿血者，加大蓟、小蓟；伴排尿不畅者，加乌药、沉香；恶心呕吐者，加半夏、竹茹；乏力多汗者，加黄芪、浮小麦；浮肿尿少者，加猪苓、泽泻；结石不易排出者，加三七粉。
除了汤药治疗外，山东省中医院还采用中成药、针灸、推拿等特色疗法治疗小儿泌尿系统结石疾病。
1.中成药治疗：“结石通”，每次1片，一日3次，用于泌尿系结石偏于湿热者；“肾石通冲剂”，每次1/3袋，一日3次，用于泌尿系结石偏于血瘀者。
2.针灸疗法：在主穴位——肾俞、膀胱俞，配穴位——腰腹痛加足三里施针，恶心呕吐加内关，排尿不畅加水道，血尿加三阴交。
3.推拿疗法：按摩腰部三焦俞、肾俞、小肠俞、膀胱俞等穴位，每日2次，每次15~30分钟，疗效甚佳。
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