对于有习惯性流产问题的妇女而言，怀孕成了又期待又恐惧的经验。造成习惯性流产的原因虽然复杂，但可大致区分成下列因素：
1.子宫构造有问题：
先天性的子宫异常，如双子宫、双角子宫、遗物角子宫、子宫中膈等，往往会造成受精卵着床或胚胎发育上的问题，可能导致怀孕中期的流产。
2.子宫颈闭锁不全：
此类后天性的子宫异常还包括了子宫肌瘤等。通常子宫闭锁不全所导致的流产约在怀孕十几周时发生，有子宫异常问题的妇女应在孕前针对异常的原因加以诊治。
3.内分泌异常：
甲状腺机能异常、糖尿病、高血压等病症，也可能导致习惯性流产。此外，黄体素不足所造成的受精卵着床失败或是自然流产，也是常见的流产原因之一。
4.病毒感染：
病毒的感染可能导致流产，包括了病原虫、巨大细胞病毒、德国麻疹等都可能是流产的原因，此外，在猫咪身上有弓浆虫带原，也是孕妇要避免接触的感染源。
5.免疫系统异常：
以母体自体免疫系统异常而言，其血液循环中往往会产生较高的自然免疫抗体，这些抗体往往会循着母体与胎儿之间的血液循环，造成胎盘坏死而流产。因免疫系统异常所导致受精卵无法着床的现象，这也是常见的不孕因素之一。
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