有人担心，微波炉加热会破坏母乳的营养，尤其是破坏其中的活性成分。有专员指出：用微波炉加热母乳原则上没有问题，微波加热的原理是加热食物中的水分子。判断一种加热方式是否会破坏营养，主要是由时间和温度决定的。时间上，微波加热只需要短短几十秒，所以只要能控制好温度，使用微波炉加热宝宝食品也是非常的。比如说母乳或者牛奶，只有温度加热到70摄氏度以上，其中的免疫球蛋白、溶菌酶、生长因子等活性物质才会大量遭受破坏。低于该温度都没有问题。
具体怎么才能控制温度，这里提供给大家一个方法：用平常装奶的容器装上水，在自家微波炉进行实验，加热到50摄氏度以下，以不烫嘴为限。首先选定一档，从30秒开始实验，根据水温再调整，多实验几次，摸索出比较佳加热时间。以后给宝宝加热奶的时候就严格按照这个档位和时间操作。
一般适合用微波炉加热的食品包括：奶、面汤等液态食物，加热之后摇一摇让温度均匀再喂孩子。
此外，母乳还有有两种简单的加热方法，都不会影响其营养价值。一种是将一盆水烧开，从火上移开，把一瓶母乳立刻放入热水中20分钟，然后冷却到37摄氏度。另一种方法为迅速加热法，水和母乳一起加热直到滚热烧开，然后将母乳从热水中取出，任其冷却。两种方法都没有明显破坏母乳的营养成分，而迅速加热法会保留更多的自然抗菌活性，两种方法都可以有效破坏细菌。
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